Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprtQ99M80 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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PtprtQ99M80 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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PtprtQ99M80 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprtQ99M80 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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