Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q99KU6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q99KU6 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Q99KU6 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q99KU6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q99KU6 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q99KU6 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q99KU6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q99KU6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q99KU6 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q99KU6 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q99KU6 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q99KU6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Q99KU6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms