Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Pacsin3Q99JB8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Pacsin3Q99JB8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pacsin3Q99JB8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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