Protein–RNA interactions for Protein: Q99J85

Nptxr, Neuronal pentraxin receptor, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NptxrQ99J85 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NptxrQ99J85 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms