Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ddb2Q99J79 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ddb2Q99J79 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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