Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ctu1Q99J10 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms