Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klc3Q91W40 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms