Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PpcsQ8VDG5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms