Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Slc6a20aQ8VDB9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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Slc6a20aQ8VDB9 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Slc6a20aQ8VDB9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Slc6a20aQ8VDB9 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Slc6a20aQ8VDB9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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