Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Top1mtQ8R4U6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Top1mtQ8R4U6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms