Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Nup58Q8R332 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Nup58Q8R332 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nup58Q8R332 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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