Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r200Q8R281 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r200Q8R281 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Vmn1r200Q8R281 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms