Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ssh3Q8K330 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms