Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gtf3c1Q8K284 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gtf3c1Q8K284 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms