Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
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FgbQ8K0E8 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
FgbQ8K0E8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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