Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Neurl3Q8CJC5 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Neurl3Q8CJC5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms