Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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Znf628Q8CJ78 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Znf628Q8CJ78 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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