Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Brf1Q8CFK2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Brf1Q8CFK2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Brf1Q8CFK2 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Brf1Q8CFK2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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