Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hpf1Q8CFE2 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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