Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cdkl1Q8CEQ0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms