Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Usp27Q8CEG8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms