Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rsph6aQ8CDR2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rsph6aQ8CDR2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms