Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp20Q8C6M1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp20Q8C6M1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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