Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ccdc113Q8C5T8 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms