Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
FarsaQ8C0C7 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
FarsaQ8C0C7 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms