Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Tnfsfm13Q8BXS2 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Tnfsfm13Q8BXS2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms