Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Lrtm1Q8BXQ3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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