Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slx1bQ8BX32 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms