Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp38Q8BW70 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp38Q8BW70 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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