Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Pggt1bQ8BUY9 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pggt1bQ8BUY9 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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