Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Kcnf1Q7TSH7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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