Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Actn1Q7TPR4 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Actn1Q7TPR4 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms