Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Smim12Q78RX3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms