Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b3Q6UQ17 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b3Q6UQ17 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b3Q6UQ17 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b3Q6UQ17 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b3Q6UQ17 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b3Q6UQ17 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b3Q6UQ17 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b3Q6UQ17 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b3Q6UQ17 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Atp8b3Q6UQ17 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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Atp8b3Q6UQ17 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Atp8b3Q6UQ17 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Atp8b3Q6UQ17 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms