Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
GcsamQ6RFH4 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms