Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp49Q6P9L4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp49Q6P9L4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp49Q6P9L4 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp49Q6P9L4 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp49Q6P9L4 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp49Q6P9L4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp49Q6P9L4 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Usp49Q6P9L4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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