Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rhox12-203ENSMUST00000183737 761 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
NipblQ6KCD5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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