Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CltbQ6IRU5 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CltbQ6IRU5 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms