Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tpm4Q6IRU2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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