Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Krt39Q6IFX4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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