Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Pdzrn3Q69ZS0 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pdzrn3Q69ZS0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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