Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kiaa1549Q68FD9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kiaa1549Q68FD9 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms