Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Sbno1Q689Z5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Sbno1Q689Z5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Sbno1Q689Z5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Sbno1Q689Z5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Sbno1Q689Z5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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Sbno1Q689Z5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sbno1Q689Z5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms