Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Defa17Q64016 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa17Q64016 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa17Q64016 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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