Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Kdm5dQ62240 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Kdm5dQ62240 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Kdm5dQ62240 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
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