Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm8824-201ENSMUST00000182962 990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gli3Q61602 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm12668-201ENSMUST00000134966 575 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gli3Q61602 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gli3Q61602 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gli3Q61602 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gli3Q61602 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gli3Q61602 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms