Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Klf3Q60980 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms