Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
JrkQ60976 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
JrkQ60976 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms