Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Rbbp4Q60972 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rbbp4Q60972 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms