Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PtprnQ60673 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms